Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms