Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc8E9PWG2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms