Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms