Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim12cD3Z3L3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms