Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms