Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms