Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ccdc170D3YXL0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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