Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rfx8D3YU81 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rfx8D3YU81 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rfx8D3YU81 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rfx8D3YU81 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rfx8D3YU81 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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