Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20547B8JJN0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms