Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms