Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms