Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms