Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms