Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms