Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Atp8b5A3FIN4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
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Atp8b5A3FIN4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Atp8b5A3FIN4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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