Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1aA2APX8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1aA2APX8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1aA2APX8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1aA2APX8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1aA2APX8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1aA2APX8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1aA2APX8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1aA2APX8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1aA2APX8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1aA2APX8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1aA2APX8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1aA2APX8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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