Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms