Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabreA2AMW3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms