Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms