Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd5A2A8L1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms