Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms