Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms