Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Robo3Q9Z2I4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms