Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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