Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cldn7Q9Z261 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cldn7Q9Z261 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cldn7Q9Z261 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cldn7Q9Z261 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cldn7Q9Z261 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cldn7Q9Z261 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cldn7Q9Z261 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cldn7Q9Z261 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Cldn7Q9Z261 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn7Q9Z261 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms