Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip6Q9Z1Y4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms