Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms