Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clip2Q9Z0H8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms