Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1a4Q9WV27 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms