Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf13bQ9WU72 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms