Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms