Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trpc2Q9R244 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trpc2Q9R244 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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