Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plod3Q9R0E1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms