Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Wdr54Q9R0D8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms