Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms