Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nphs1Q9QZS7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nphs1Q9QZS7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nphs1Q9QZS7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nphs1Q9QZS7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nphs1Q9QZS7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Nphs1Q9QZS7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Nphs1Q9QZS7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms