Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms