Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh11Q9QYF1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms