Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms