Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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