Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms