Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Tgm1Q9JLF6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tgm1Q9JLF6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tgm1Q9JLF6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tgm1Q9JLF6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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