Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ldb3Q9JKS4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms