Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms