Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ybx3Q9JKB3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms