Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gfra4Q9JJT2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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