Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp29Q9ES63 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms