Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms