Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms