Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms